黨組織于公司成立之初同步建立，隨著經營業務的發展和組織隊伍的壯大經集團黨委批準，自2017年公司成立了中國共產黨中鐵上海設計院集團有限公司委員會。

合肥院黨委下設3個黨支部，黨員人數占全院職工總人數的57%。